GBK2CLUSTERS

O que é

O GBK2CLUSTERS é um conjunto de funções do MATLAB que tem por objetivo facilitar a identificação e organização de clusters – conjunto de genes relacionados e codificados especificamente para um evento biológico em um organismo – baseado nas descrições dos produtos dos genes conforme anotados em arquivos de extensão GBFF ou GBK padrão do GenBank Database (sequências de organismos anotadas). Assim, o GBK2CLUSTERS permite definir que tipo de cluster (ou núcleo gênico) o usuário deseja buscar – por exemplo, um cluster de fixação de nitrogênio – para a realização de estudos específicos em bioinformática. Essas funções requerem a instalação do pacote de bioinformática do MATLAB ou ao menos ter a função seqrcomplement.m incluída nos recursos.

Devido ao grande volume de dados biológicos disponível em literatura, emerge-se a necessidade da criação de métodos e ferramentas em bioinformática para lidar com extração de informações biológicas relevantes a um determinado fim numa pesquisa biológica. A técnica desenvolvida em GBK2CLUSTERS visa facilitar a identificação e organização de clusters – conjunto de genes relacionados e codificados especificamente para um evento biológico em um organismo – afim de otimizar a extração de informações de núcleos gênicos de interesse biológico utilizando Data Mining como recurso de maneira acessível a qualquer pesquisador que lida com grande volume de dados.

Disponível para

Distribuição Gratuita

INFORMAÇÕES DO PROGRAMA

NÚMERO: BR5120190012402

STATUS: Registrada em 25/06/2019

TITULARES: Universidade Federal do Paraná

AUTORES: Roberto Tadeu Raittz, Bruno Thiago de Lima Nichio e Rafael Prazeres de Souza Lobo

CAMPOS DE APLICAÇÃO: Biologia, Genética, Microbiologia e Bioquímica

TIPO DE PROGRAMA: Aplicações Técnico-Científicas e Utilitários

PALAVRAS-CHAVE: Inteligência Artificial, Data mining, Extração de características, Genética evolutiva

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