Identificação de novos lncRNAs mapeados em regiões ultraconservadas transcritas com importância clínica no câncer

O câncer de mama é a neoplasia mais comum e uma causa importante de mortalidade entre as mulheres. Levando em conta a heterogeneidade do câncer de mama, são utilizadas na prática clínica ferramentas que possibilitam um melhor diagnóstico e classificação da doença, porém, as classificações disponíveis ainda não são suficientes para prever os desfechos clínicos de todos os pacientes, adicionalmente a falta de terapia específica em alguns grupos. Portanto, a identificação de novos marcadores moleculares e potenciais novos alvos terapêuticos são essenciais. De forma geral, temos o objetivo de identificar lncRNAs com potencial regulador de redes genéticas nos diferentes subtipos de câncer de mama, com enfoque principal nas regiões ultra conservadas transcritas, ainda pouco exploradas. Recentemente, nosso grupo de pesquisa identificou e caracterizou um novo lncRNA transcritos a partir de uma região ultraconservada (UCRs) do genoma. As chamadas UCRs referem-se a um conjunto de 481 sequências do genoma com mais de 200 pares de bases que são 100% conservadas nos genomas humano, do rato e camundongo, sendo que a maioria delas se encontra em porções não codificantes do genoma. Nesse trabalho prévio, realizamos a análise das 481 UCRs em câncer de mama e evidenciamos que mais de 60% dessas regiões estão associadas com algum parâmetro clínico desse tipo tumoral. Em destaque, encontramos que o RNA produzido a partir da região uc.147 está aumentada nas pacientes luminal A com pior sobrevida, o que enfatiza sua importância como potencial biomarcador adicional aos marcadores já existentes. Porém, esse RNA nunca tido sido caracterizado ou associado com mecanismos celulares anteriormente. Em colaboração com o Dr Calin, do MD Anderson Cancer Center-EUA, conseguimos caracterizar a composição nucleotídica/localização celular, influência desse RNA na viabilidade, ciclo celular e taxas de apoptose celular. Portanto, conseguimos descrever de forma inédita um novo lncRNA, o lnc-uc.147, porém, os mecanismos moleculares responsáveis pelo efeito oncogênico ainda são desconhecidos. Adicionalmente, uma possível associação da expressão do lnc-uc.147 em outros tipos tumorais nunca foi investigado. Visto o importante papel oncogênico do lnc-uc.147 em pacientes com câncer de mama, o presente trabalho tem por objetivo a análise de expressão do lnc-uc.147 em diversos tipos de tumores a partir de resultados de sequenciamento global de RNA armazenados no banco de dados TCGA, além de investigar os mecanismos moleculares de ação dessa molécula em linhagens de câncer de mama e outras que sejam associadas com esse lncRNA. A pouca informação sobre a relação das T-UCRs no câncer e a importância de se reconhecer mecanismos de ação de um novo lncRNA, pioneiramente por nós descrito, atestam a relevância desse projeto. Adicionalmente, nosso estudo poderá contribuir para uma melhor compreensão da fisiopatologia do câncer e poderá auxiliar no desenvolvimento de marcadores de prognóstico mais específico que os atualmente disponíveis.